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自主体功能区战略实施以来,指标计算体系总是显得过于庞大.为了更准确、合理、快速的对主体功能区评价指标进行分析计算,本文针对功能区评价指标体系的特点,提出将所有指标分类后从数据源获取、配置计算方法、计算过程流程化等方面进行规范化计算的方法.该方法在运算思维的条理性、计算的简便性、后期修改的灵活性方面有大幅提升.这种基于GIS的主体功能区评价指标计算方法可以极大的简化系统程序,同时对于加强程序的独立性以及计算功能的简便灵活方面具有较强的意义和较高的应用价值.