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目的了解2009—2011年广州地区儿童呼吸道感染的流感病毒分子流行病学特点，以达到呼吸道感染监控与预防目的。方法采集2009年1月-2011年12月广州市妇女儿童医疗中心就诊的呼吸道感染患儿咽拭子等标本50401份，荧光RT—PCR检测流感病毒A、B型，设计扩增流感病毒全基因组序列的引物，随机选取4株病毒进行全基因组序列测定。结果3年检测流感A型标本共50401份，阳性标本6838份，总检出率为13．56％；检测流感B标本共43576份，阳性标本为2038份，总检出率为4．67％；4株流感病毒全基因组序