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科学合理地选择现代农业主导产业是新农村建设和农村经济发展寻求产业支撑的根本所在。借鉴经济学有关理论,建立了现代农业主导产业选择指标体系,重点分析了部分指标,并进行测算。同时以三峡库区万州为例进行实证分析。结果表明,作为库区,万州现代农业主导产业的发展应该选择烟叶、奶业、水产业、水果、蔬菜等前五位农业产业进行优先培育。