紫杉醚与αβ微管蛋白的分子对接

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采用InsightⅡ/Affinity对紫杉醚与αβ微管蛋白进行分子对接,共得到10个对接构象.应用密度泛函B3LYP/6-31G方法计算对接口袋构象的结合能,筛选出结合能达-190.53kJ·mol^-1的最优对接构象5.通过构象分析建立紫杉醚与受体结合的作用模型,结果表明,在活性口袋的底部紫杉醚与受体间的作用主要是疏水作用,而在活性口袋的顶部两者间主要是氢键作用.氢键作用位置可分为A和B两个作用区,其中A区有3个氢键,由C13侧链分别与受体的ASP26和ARG369作用形成;B区也有3个氢键
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