【摘 要】
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为了解H5N2亚型禽流感病毒（Avian influenza virus,AIV）的血凝素蛋白（Hemag-glutinin,HA）系统进化特征,借助NCBI influenza virus resource数据库,下载禽源A型流感病毒（Influenza A Virus,IAV）H5N2亚型HA核酸序列,分析毒株的宿主、分离时间等特征,并构建HA蛋白的遗传进化树,分析其系统发生。结果显示:NCB
【基金项目】
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云南国际性高原湿地迁徙型涉禽禽流感等动物疫病监测研究（1963037）；
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为了解H5N2亚型禽流感病毒（Avian influenza virus,AIV）的血凝素蛋白（Hemag-glutinin,HA）系统进化特征,借助NCBI influenza virus resource数据库,下载禽源A型流感病毒（Influenza A Virus,IAV）H5N2亚型HA核酸序列,分析毒株的宿主、分离时间等特征,并构建HA蛋白的遗传进化树,分析其系统发生。结果显示:NCBI数据库收录的H5N2 AIV的HA核酸序列1 272条,序列在NCBI发布时间集中于2005—2007年、2011年、2014—2016年;582条序列为野禽来源,宿主主要分布于雁形目、鸡形目和鸻形目的野禽。系统发生分析结果表明:H5N2 AIV的HA蛋白可聚类为亚欧谱系及北美谱系两大分支,前者可分为三个亚系,后者可分为两个亚系。研究结果呈现了H5N2 AIV HA基因在时间及空间上的进化特征,为H5N2AIV引起的疫病预警和防控提供理论基础。
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