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发酵床养猪的原理与农田有机肥被分解的原理基本一致，主要是运用土壤里自然生长的土壤微生物来迅速降解猪的排泄物。从1992年开始，日本鹿儿岛大学的专家教授开始对发酵床养猪进行了系统研究，形成了较为完善的技术规范。1999年，在鹿儿岛大学农学部附属农场召开了发酵床养猪技术的应用和推广观摩会，有来自10多个国家的1000多名专家、学者和农户参加了这次会议。从此，发酵床养猪得到了广泛的应用和推广。