目的探讨甜菜红素对HeLa细胞增殖及与丙酮酸代谢和糖酵解的关系。方法在体外培养HeLa细胞,贴壁后加入0、62.5和500 mg·L^-1甜菜红素,48 h后收获细胞分别进行细胞计数和低温保存。以人基因组为参考,将冷冻细胞进行高通量转录组测定和计算,并利用互联网数据库,选取其糖酵解、丙酮酸代谢和柠檬酸循环部分进行分析,以研究甜菜红素对HeLa细胞增殖、糖酵解与氧化途径蛋白质编码转录本表达的影响。结果二个浓度的甜菜红素均抑制培养HeLa细胞的增殖,并且影响培养细胞的转录本reads数。HeLa细胞表达的蛋白编码转录本有74种,其中reads数大于1和reads数小于1但处理间差异显著的共40种。甜菜红素显著上调HeLa细胞糖酵解限速酶血小板型磷酸果糖激酶（ENST00000381075）和糖异生限速酶果糖-1,6-二磷酸酶1（ENST00000375326）编码蛋白转录本表达,有利于细胞代谢,可能是细胞对甜菜红素的应激反应。甜菜红素对柠檬酸循环的蛋白编码转录表达没有显著影响。然而,甜菜红素显著下调HeLa细胞线粒体乳酸脱氢酶D（ENST00000450168）（LDHD）编码蛋白转录本的表达,并且对磷酸烯醇化丙酮酸羧激酶2（线粒体）（ENST00000396973）（PEPCK）也呈下调趋势,它们均与丙酮酸代谢有关。结论甜菜红素抑制HeLa细胞的增殖与线粒体丙酮酸代谢的LDHD和PEPCK蛋白编码的转录下调有关。