2016—2017年安徽省诺如病毒感染的散发病例基因型别分析

来源 :中华实验和临床病毒学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wang840911
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目的

分析安徽省2016—2017年诺如病毒(Norovirus,NoV)感染的散发病例基因型别分布和分子进化特征。

方法

收集2016年1月至2017年12月全省哨点医院腹泻患者NoV阳性粪便标本,采用Real-time PCR检测NoV GI和GII基因组,选择部分阳性标本经RT-PCR扩增衣壳蛋白(VP1)区部分序列,进行核苷酸序列测定和遗传进化树分析。

结果

263份NoV阳性标本中GII组239份,占90.9%; GI组24份,占9.1%。成功测序的55株GII基因组中检出GII.2、3、4/Sydney_2012、13、17、21共6个NoV GII型亚型存在,其中主要的基因型为GII. 4/Sydney 2012,占47.27%(26/55),其次为GII.17(23.64%,13/55)和GII.2(14.55%,8/55),遗传进化树显示:26株GII.4型间核苷酸序列同源性为97.8%~100%,与参考株GII.4Sydney 2012(GenBank登录号:KU720515)同源性最高为98.9%。2016年NoV的优势流行株为GII.17变异株,2017年的优势流行株为GII.4/Sydney 2012变异株。

结论

2016—2017年安徽省NoV感染性腹泻流行毒株仍以GII组为主,基因亚型存在多样性,两个主要基因型更替流行。

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