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为建立一种准确、快速鉴定小麦茎基部土传真菌病害的方法，根据Genbank中四种病菌的生物信息数据库，设计了4对病原菌特异引物，同时采用一种从小麦组织中快速提取病原菌DNA的方法，利用PCR技术实现了对小麦基部叶鞘中侵染的病原菌种类的快速有效检测。对来自不同地区的小麦试样的PCR检测结果表明，禾谷丝核菌和雪腐镰刀菌存在不同程度的共侵染现象，而引起中国小麦赤霉病的禾谷镰刀菌并不是引起小麦基腐的主要病原。