糖尿病和糖尿病肾病小鼠肾组织中长链非编码RNA的差异表达

来源 :中华肾脏病杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yanghao_haohao
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目的

分析发生蛋白尿和不发生蛋白尿的db/db糖尿病(DM)小鼠肾组织中的长链非编码RNA(lncRNA)的差异表达,为探索糖尿病肾病(DN)的发病机制提供依据。

方法

随机挑选周龄相同的小鼠正常(db/m小鼠)组、DM(db/db小鼠)组各3只,DN(db/db小鼠)组2只,采用Illumina高通量测序得到3组小鼠肾组织组间差异表达lncRNA、mRNA及各自表达丰度值(fragments per kilobase million,FPKM)。通过lncRNA基因座位置等预测lncRNA的靶基因;通过GO、KEGG等数据库预测差异表达lncRNA的生物学功能。提取各小鼠肾组织的总RNA,使用实时定量PCR(RT-qPCR)筛选变化趋势与测序结果一致的lncRNA。

结果

与DM组小鼠相比,DN组小鼠尿白蛋白肌酐比(UACR)、血肌酐、肾小球基底膜厚度均显著升高(均P<0.05),而血糖差异无统计学意义(均P>0.05);与DM组小鼠相比,DN组小鼠有160个lncRNA表达上调,99个lncRNA表达下调;筛选小鼠DM及DN组FPKM均≥2及组间差异表达倍数≥1的差异表达lncRNA,进行RT-qPCR验证,得到3个与测序结果一致的lncRNA。

结论

DM和DN db/db小鼠肾组织中lncRNA表达存在显著差异,这种差异表达有可能参与了DN的发病。

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