【摘 要】
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MITEs(miniature inverted-repeat transposable elements)又称颠倒重复序列,是缺少转座酶序列的非自主型转座子,在真核生物基因组含量丰富,是基因组多态性形成的重要驱动力
【机 构】
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浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室,杭州311300
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MITEs(miniature inverted-repeat transposable elements)又称颠倒重复序列,是缺少转座酶序列的非自主型转座子,在真核生物基因组含量丰富,是基因组多态性形成的重要驱动力之一.该研究利用MITE Tracker软件,在毛竹(Phyllostachys edulis)新版基因组中鉴定到1 579个MITEs家族,共包括18 373个全长MITEs,占毛竹基因组的0.34％,被归入到7个超家族.超家族的插入时间跨度为0.5～16.5 mya,其中有3个超家族在2～4 mya经历过一次扩增事件;2个超家族分别在1～2 mya和3～5 mya经历两次扩增事件;2个超家族在0.5～16.5 mya经历一次长期扩增.MITEs偏好插入基因或基因附近,且Micron-like超家族偏好插入ATT与ATA之间.该研究开发了3个分子标记,可从12份雷竹变种变型材料中鉴定出4份.综上所述,该文主要分析了毛竹基因组中MITEs的分布、进化及插入情况,并获得了3对可以区分雷竹变种变型的分子标记,为下一步验证MITEs功能奠定基础.
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