PTK7基因在脑胶质瘤中表达和临床预后的生物信息数据集分析

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目的:研究PTK7基因在脑胶质瘤中的表达并分析其与临床病理参数及预后的关系.方法:通过生物信息数据库和分析工具,分析PTK7基因mRNA在泛癌组织中的表达,并比较其在脑胶质瘤组织和正常脑组织的表达水平差异,解析PTK7基因突变及甲基化情况,构建蛋白质相互作用网络,进行GO和KEGG富集,探讨其mRNA表达水平与脑胶质瘤相关临床参数和预后的相关性.结果:PTK7基因mRNA在多种肿瘤中表达,在脑胶质瘤中表达水平中等.PTK7基因mRNA在脑胶质瘤组织表达水平较对照正常脑组织高,且随着脑胶质瘤分级升高而升高.PTK7在脑胶质瘤中存在突变,还存在基因融合、扩增,PTK7表达与脑胶质瘤的WHO分级、异柠檬酸脱氢酶状态和病理类型相关(P<0.001).基于CGGA数据的生存分析显示,在脑胶质瘤中PTK7基因mRNA低表达组预后优于高表达组(P<0.001),在复发脑胶质瘤中存在同样差异(P=0.013).基于TCGA脑胶质瘤数据分析显示PTK7低表达者预后均优于高表达组,总生存和无病生存差异均具有统计学意义(P<0.001).结论:PTK7可能发挥癌基因作用参与脑胶质瘤发生和发展过程,针对PTK7基因的靶向治疗可能是未来的研究方向.
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