基于生物信息学探讨肾透明细胞癌女性与男性的DNA甲基化谱的异同

来源 :现代泌尿生殖肿瘤杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liubin121366
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目的分析女性与男性肾透明细胞癌的DNA甲基化谱之间的异同,为临床个性化诊断与治疗肾透明细胞癌提供新的理论依据。方法从肿瘤基因组图谱(TCGA)与基因芯片公共数据库(GEO)中下载两种性别的肾透明细胞癌的DNA甲基化芯片数据,使用R语言minfi包对芯片数据进行预处理、对癌与癌旁组织进行差异分析,对两套不同来源的数据进行差异甲基化位点整合分析;使用单因素Cox回归分析计算预后甲基化位点;从生物通路角度,探讨差异甲基化位点与预后甲基化位点所涉及的潜在生物学功能。结果女性与男性肾透明细胞癌的差异DNA甲基化位点
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