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转座子的鉴定和描述是研究水稻基因组生物学功能的一个基础;采用一个较新的逆转座子预测软件LTR_FINDER从水稻品种日本晴372Mb基因组(TIGR Release 5)中鉴定到6,460个全长LTR逆转座子,并根据其内部主要结构域的有无进行了详细分类,共分成29种结构区域类型(SDCs)。