【摘 要】
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目的 利用网络药理学方法探讨保元汤治疗扩张型心肌病(dilated cardiomyopathy,DCM)的作用机制.方法 应用中药系统药理学分析平台(TCSMP)及中药分子作用机制的生物信息学分析工具(BATMAN-TCM)、Pubchem、SwissTargetPrediction、Uniprot等数据库筛选保元汤活性成分及其作用靶点,基于人类基因数据库(GeneCards)、在线《人类孟德尔遗传》数据库(OMIM)获取扩张型心肌病相关靶点,二者相互映射获得药物与疾病共同靶点.利用Cytoscape软
【机 构】
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广州中医药大学第一附属医院,广东广州510405;广州中医药大学第一临床学院,广东广州510405
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目的 利用网络药理学方法探讨保元汤治疗扩张型心肌病(dilated cardiomyopathy,DCM)的作用机制.方法 应用中药系统药理学分析平台(TCSMP)及中药分子作用机制的生物信息学分析工具(BATMAN-TCM)、Pubchem、SwissTargetPrediction、Uniprot等数据库筛选保元汤活性成分及其作用靶点,基于人类基因数据库(GeneCards)、在线《人类孟德尔遗传》数据库(OMIM)获取扩张型心肌病相关靶点,二者相互映射获得药物与疾病共同靶点.利用Cytoscape软件构建“保元汤成分-靶点”“保元汤-成分-DCM-靶点”网络图.采用String、Cytoscape软件构建蛋白相互作用(PPI)网络及筛选关健基因(Hub基因).通过R软件进行基因本体(GO)聚类分析及京都基因与基因百科全书(KEGG)通路富集分析.使用PDB、PubChem数据库,PyMOL、ChemBio3D及AutoDock vina软件进行分子对接.结果 共筛选出保元汤活性成分120个,保元汤治疗扩张型心肌病潜在靶点91个,富集分析显示102条GO条目,152条KEGG通路.主要活性成分包括五味子酯乙、花生四烯酸、脱氧三尖杉酯碱、槲皮素、原花青素B1等;关键靶点有丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、血管内皮生长因子α(VEGFA)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、表皮生长因子(EGFR)、肿瘤蛋白P53(TP53)、胱天蛋白酶3(CASP3)、肿瘤坏死因子(TNF)等;主要涉及MAPK信号通路、cGMP-PKG信号通路、PI3K-Akt信号通路、癌症中的蛋白聚糖等通路.分子对接初步验证了保元汤主要活性化合物与核心靶点有较高的结合活性,与临床治疗DCM的药物相当.结论 保元汤可能通过保护心肌线粒体、调节心肌能量代谢、调控心肌细胞凋亡及自噬、抑制心肌纤维化等机制,发挥治疗扩张型心肌病的作用.
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