基因组规模代谢网络模型的自动化重构

来源 :食品与生物技术学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：hua6952

【摘要】

：

对基于KEGG在线数据库、Uniprot-MetaCyc数据库,以及同源比对3种构建基因组规模代谢网络模型的方法进行了自动化研究.同时提出了基于反应式字符频度直方图的马氏距离比对算法

【作者】

：

柴文平薛卫张梁石贵阳

【机构】

：

粮食发酵工艺与技术国家工程实验室江南大学,南京农业大学信息科学技术学院

【出处】

：

食品与生物技术学报

【发表日期】

：

2014年9期

【关键词】

：

基因组规模代谢网络自动化重构直方图 genome-scale metabolic networks auto-reconstruction histogr

【基金项目】

：

江苏省自然科学基金项目（BK2012363,BK2011153）.

下载到本地 , 更方便阅读

下载此文赞助VIP

声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架

论文部分内容阅读

对基于KEGG在线数据库、Uniprot-MetaCyc数据库,以及同源比对3种构建基因组规模代谢网络模型的方法进行了自动化研究.同时提出了基于反应式字符频度直方图的马氏距离比对算法,并应用于模型整合和模型核心反应的识别.上述自动化方法的研究均在树干毕赤酵母基因组规模代谢网络重构过程中得到运用实施,对于提高模型构建效率意义重大.

其他文献

特养利用中草药效果佳

期刊

特种经济动物中草药病害防治养殖

腌制苋菜梗的微生物菌群结构及其品质

腌制苋菜梗是浙东传统的特色腌制食品,了解其细菌种群结构并探讨对亚硝酸盐等理化品质的影响,以确保腌制食品的安全性.采用16s rdna基因克隆文库的方法,对腌制成熟的苋菜梗中

期刊

腌制苋菜梗16srdna克隆文库菌群结构品质fermented amaranth stem16S rDNA colone librarymicro

超声刀与高频电刀在腹腔镜下广泛性全子宫切除的临床疗效对比

目的探讨超声刀与高频电刀在腹腔镜下广泛性全子宫切除术中应用的临床疗效比较。方法回顾性分析我院166例腹腔镜下广泛性全子宫切除的病例资料,其中87例患者术中采用电刀为A

期刊

超声刀高频电刀全子宫切除疗效

兵团科研基础条件建设的问题与对策

兵团科技局党组从落实科学发展观的高度出发，主动、认真、扎实地开展了兵团科研基础条件暨仪器设备调研活动。

期刊

兵团基础科研科学发展观仪器设备

电冰箱高节电智能电子转换器

<正>电冰箱高节电智能电子转换器适用于各类电冰箱的节电及保护。目前,我国家庭拥有冰箱达1.2亿台,电冰箱行业产量已居世界前列。在家庭用电中,电冰箱是用电“大户”,其耗电

期刊

电冰箱节电智能电子转换器产品特点生产

特种“紫娟”红茶与滇红茶香气成分的比较

为了探明紫娟茶的适制性,采用全自动顶空固相微萃取结合气质联用法对紫娟红茶的香气成分进行了定性定量分析,并与滇红茶的香气成分进行比较。结果从紫娟红茶中鉴定出香气成分

期刊

紫娟红茶滇红茶顶空固相微萃取香气成分气质联用

产业集聚对我国雾霾污染的影响研究

雾霾天气的频繁出现不仅影响了人们的日常出行,也增加了心脑血管疾病、肺癌等疾病的发病率,引起了公众的广泛关注。雾霾污染的产生尽管是多种因素综合作用的结果,但归根到底

会议

产业集聚雾霾污染外部性雾霾防治

黄酒中氨基甲酸乙酯直接减除技术的研究

黄酒中含有微量氡基甲酸乙酯(ethyl carbamate),简称ec,直接降低黄酒中的ec含量,具有重要的现实意义.在各种吸附性材料中,优选得特异性功能树脂材料l2、l3,复配后以合适的添

期刊

树脂直接减除氨基甲酸乙酯(EC)黄酒resindirectly removalethyl carbamateChinese rice wine

超声波诊断癌症

期刊

超声波诊断癌症诊断价值

后腹腔镜下输尿管切开取石术治疗输尿管上段结石的疗效分析

目的探讨后腹腔镜下输尿管切开取石术治疗输尿管上段结石的疗效。方法回顾性分析本科收治的42例行后腹腔镜下输尿管切开取石术治疗的输尿管上段结石患者的临床资料。结果 41

期刊

腹腔镜输尿管结石

基因组规模代谢网络模型的自动化重构

与本文相关的学术论文