人TERT基因启动子区生物信息学分析

来源 :肿瘤预防与治疗 | 被引量 : 1次 | 上传用户:jjy2005
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目的:探讨人端粒酶逆转录酶基因启动子区的序列特征、转录因子及其结合位点。方法:从NCBI数据库中获取人TERT基因组序列及其启动子序列:利用EMBOSS 6. 6. 0、Cp G finder 1. 0和MethPrimer 1. 0软件预测启动子区Cp G岛的位置;利用Patch 1. 0和PROMO 3. 0. 2软件预测可与TERT基因结合的潜在转录因子及结合位点。结果:TERT基因定位于5p15. 33,基因序列全长共41 881 bp,其启动子位于TERT基因5’端上游2 500 bp处,全长2 043bp。TERT基因启动子区可能存在2个Cp G岛和118个转录因子。结论:通过生物信息学软件对h TERT基因启动子进行预测分析,可提高对h TERT基因启动子的研究效率,以便更加深入了解h TERT基因的调控机制及其生物学功能。
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