新城疫病毒P/V/W基因编码产物功能结构域的分析及定位

来源 :生物技术通报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：qq3264132

【摘要】

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NDV的P基因能够通过RNA编辑机制编码3种病毒蛋白P、V和W。为了初步确定新城疫病毒P、V和W的功能结构域及其在P基因中位置,对这3种具有相同N端不同C端的病毒蛋白进行生物信息

【作者】

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仇旭升孟春春于洋陈鸿军于圣青丁铲

【机构】

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中国农业科学院上海兽医研究所,扬州大学农业部畜禽传染病学熏点开放实验室

【出处】

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生物技术通报

【发表日期】

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2011年1期

【关键词】

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新城疫病毒 P蛋白 V蛋白生物信息学功能结构域 Newcastle disease virus Phosphoprotein V protein Bioin

【基金项目】

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国家自然科学基金重点项目（30630048）, 2010年中央公益性研究院所基础业务专项经费项目（2010JB24）

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NDV的P基因能够通过RNA编辑机制编码3种病毒蛋白P、V和W。为了初步确定新城疫病毒P、V和W的功能结构域及其在P基因中位置,对这3种具有相同N端不同C端的病毒蛋白进行生物信息学分析。分别设计针对基因Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ和Ⅶ型以及class Ⅰ NDV毒株P基因的引物。RT-PCR获得5种基因型NDV P基因的正确序列。通过核苷酸序列预测P基因表达产物的氨基酸序列,并进行二级结构预测和三级结构模拟。将SV5 V蛋白空间结构作为模板,从而分析获得了NDVP/V/W基因编码产物的二级结构以及部分空间结构。综合各种分析

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