目的对2013～2016监测年度聊城市流感网络实验室分离的甲型H1N1流感病毒HA、NA基因进行研究,了解其变异情况。方法采集哨点医院流感样病人的鼻咽拭子标本接种于MDCK细胞进行病毒分离培养及分型鉴定,随机抽取分离的19株甲型H1N1流感病毒进行HA、NA基因序列扩增,并送生物公司进行基因序列测定,利用DNAStar作基因序列拼接整理、Mega 6.0软件作基因氨基酸进化分析。结果 2013年4月1日至2016年3月31日,共对2 137份标本进行MDCK细胞病毒分离,共检测出280株流感毒株,阳性率为13.10%,其中新甲型H1N1流感69株,分离率为24.64%。随机抽取19株新甲型H1N1流感作基因序列分析,HA基因、氨基酸序列同源性分别为97.0%～100.0%、98.2%～100.0%,NA基因、氨基酸序列同源性分别为97.1%～100.0%、95.1%～100.0%;与A/California/07/2009(H1N1)相比,HA基因、氨基酸同源性分别为96.8%～98.2%、96.5%～97.8%,NA基因、氨基酸同源性分别为96.5%～98.8%、93.6%～98.0%。基因进化树显示,聊城市甲型H1N1病毒的HA基因、NA基因均与疫苗株为一个大分支,大分支里面又分成2个小分支;其中,4株2016年分离株与疫苗株亲缘关系最近,3株2014年分离株与疫苗株关系较近,12株2016年分离株疫苗株亲缘关系较远。结论测序毒株在HA基因关键位点均发生氨基酸替换,聊城市甲型H1N1流感分离株发生HA蛋白抗原性漂移;NA蛋白的活性中心及糖基化位点均未发生变化,病毒对神经氨酸酶抑制药物敏感性未发生变化,药物依然有效。