【摘 要】
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目的:运用网络药理学的方法探讨温肾宣痹方治疗膝骨关节炎的作用机制.方法:通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)获得温肾宣痹方的相关活性成分以及靶点,从GeneCards数据库、人类基因及遗传疾病在线目录(OMIM)数据库获取与膝骨关节炎相关的靶点,两者的交集即为温肾宣痹方-膝骨关节炎疾病交集靶点;筛选核心靶点基因,使用蛋白互作与功能富集分析平台(STRING)构建靶点基因蛋白互作网络(PPI);利用Cytoscape3.7.1软件构建温肾宣痹方-药物成分-交集靶点-疾病调控网络;最后对交集靶点进行基因本
【机 构】
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南京中医药大学附属医院/江苏省中医院 骨伤科,江苏 南京 210029;南京中医药大学第一临床医学院,江苏 南京 210029
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目的:运用网络药理学的方法探讨温肾宣痹方治疗膝骨关节炎的作用机制.方法:通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)获得温肾宣痹方的相关活性成分以及靶点,从GeneCards数据库、人类基因及遗传疾病在线目录(OMIM)数据库获取与膝骨关节炎相关的靶点,两者的交集即为温肾宣痹方-膝骨关节炎疾病交集靶点;筛选核心靶点基因,使用蛋白互作与功能富集分析平台(STRING)构建靶点基因蛋白互作网络(PPI);利用Cytoscape3.7.1软件构建温肾宣痹方-药物成分-交集靶点-疾病调控网络;最后对交集靶点进行基因本体论(GO)富集分析及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,得出温肾宣痹方-膝骨性关节炎共同靶标的可能作用机制及相关信号通路.结果:检索并筛选后共取得温肾宣痹方的196个有效成分和222个作用靶点,通过GeneCards及OMIM数据库筛选出膝骨关节炎相关靶点基因2064个,取其交集得到药物-疾病交集靶基因116个,筛选后得到核心靶点基因57个.GO富集结果显示,分子功能主要聚集在细胞因子活性、细胞因子受体结合、核受体的活动、配体激活的转录因子活性、DNA结合转录激活因子活性等方面.KEGG富集分析显示,作用机制可能与晚期糖基化终末产物及其受体(AGE-RAGE)协同信号通路、白介素-17(IL-17)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路等有关.结论:温肾宣痹方治疗骨关节炎具有多系统、多靶点的特点,其可能的机制是通过AGE-RAGE信号通路、IL-17信号通路、TNF信号通路作用于白介素-6(IL-6)、蛋白激酶B(AKT1)、血管内皮生长因子(VEGFA)等核心靶点,干预炎症反应,调节免疫功能,抵抗氧化应激,控制疾病的发生发展.
其他文献
目的:探讨二甲双胍对妊娠期糖尿病(gestational diabetes mellitus,GDM)孕妇和新生儿体内长链脂肪酸(long-chain fatty acid,LCFA)含量和成分的影响.方法:选取2018年8月-2020年8月南京医科大学附属常州妇幼保健院分娩的孕妇127例,糖耐量正常孕妇(N组,32例)和仅需饮食控制的GDM孕妇(G1组,32例)作为对照,将需药物治疗的GDM孕妇按随机并自愿原则分别纳入二甲双胍治疗组(G2组,33例)和胰岛素治疗组(G3组,30例).比较各组分娩前血糖、
目的:探讨老年2型糖尿病患者加用达格列净后对肾功能和钙磷代谢的影响.方法:回顾性分析2018年1月至2020年9月于我院就诊的45例老年2型糖尿病患者的临床资料,比较加用达格列净治疗前后肾功能相关指标及钙磷代谢指标.结果:与治疗前相比,加用达格列净后治疗后血肌酐明显降低,肾小球滤过率明显升高(P0.05);钙磷代谢方面,血钙明显升高(P0.05).结论:达格列净在老年2型糖尿病患者治疗过程中,可降低患者血肌酐,增加肾小球滤过率,有较好的肾脏保护作用.关于钠-葡萄糖协同转运蛋白2(SGLT2)抑制剂与钙、磷
目的:通过构建阴道润滑障碍(lubrication disorder,LD)女性阴道上皮组织差异表达lncRNA-mRNA共表达网络,探索LD患者的潜在发病机制.方法:利用以|Log2FC|≥2且校正后P值＜0.05,鉴别LD和正常对照组之间的长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)以及mRNA的表达谱,利用Cytoscape软件构建差异表达lncRNA及差异表达mRNA网络,采用Gene Ontology (GO)和KEGG Pathway分析共表达网络中mRNA的生物学
目的:通过光学相干断层显像(optical coherence tomography,OCT)观察经皮冠状动脉介入治疗(percutaneous coro-nary intervention,PCI)术后1年,聚合物可降解药物涂层支架(Firehawk)与永久性聚合物药物涂层支架(Xience系列)内新生内膜增生的差异,旨在观察可降解聚合物及永久性聚合物对支架内新生内膜增生的影响.方法:本研究为单中心、回顾性设计,入选2014年1月-2019年6月在南京市第一医院心内科行PCI术且术后1年有冠脉造影+OC
目的:探讨长链非编码RNA (long non-coding RNA,lncRNA) H19的rs2839698、rs217727、rs3741216和rs3741219这4个位点的多态性遗传变异对肾细胞癌(renal cell carcinoma,RCC)易感性和预后的影响.方法:本研究为自2004年5月开始的两阶段病例对照研究,共纳入1014例RCC患者及1063例健康对照者.其中第一阶段298例RCC患者具有完整的随访资料.采用TaqMan探针法实时聚合酶链反应检测患者外周血的4个位点多态性基因分型
目的:探讨血清载脂蛋白A1 (apolipoproteinA1,APOA1)、胆碱酯酶(cholinesterase,CHE)在妊娠期肝内胆汁淤积症(intrahepatic cholestasis of pregnancy,ICP)诊断及程度判定中的应用价值.方法:采用回顾性病例对照研究,选取100例ICP患者和100例正常妊娠女性为研究对象.分析比较两组血清APOA1、CHE水平,采用受试者工作特征(receiver operating charac-teristic,ROC)曲线分析两者对ICP诊断
目的:筛选并验证分析与新生儿急性呼吸窘迫综合征(acute respiratory distress syndrome,ARDS)相关的微小核糖核酸(miRNA),初步研究患儿血浆中miR-6833-3p的表达水平及其诊断效能.方法:选取南京医科大学附属儿童医院25例ARDS患儿(ARDS组)为研究对象,同期选取32例普通新生儿为对照组.采用微流体芯片技术筛选与新生儿ARDS相关的miRNA,对于组间差异表达超过5倍的miRNA进一步进行实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-PCR)验证芯片重复性及进行靶基因
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目的:探讨ABVD(阿霉素、博来霉素、长春碱、氮烯咪胺,简称ABVD)方案化疗对霍奇金淋巴瘤(Hodgkin\'s lympho-ma,HL)患者睾丸氟代脱氧葡萄糖(18F-FDG)代谢的影响.方法:回顾性分析34例(均行6个疗程的ABVD方案化疗)利用18F-FDG PET/CT进行疗效评估的HL患者资料.收集患者4次行18F-FDG PET/CT检查时(基线期及每2次疗程化疗行一次检查)的血糖、体重、注射剂量、注射时间、睾丸及纵隔血池的最大标准摄取值(SUVmax).分析HL患者在4次18F-FD