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把20种氨基酸简化为3类：疏水氨基酸（hydrophobic，H）、亲水氨基酸（hydrophilic，P）及中性氨基酸（neutral，N），每个氨基酸简化为一个点，用其Cα原子来代替．采用非格点模型，以相对熵作为优化函数，进行蛋白质三维结构预测．为了与基于相对熵方法的蛋白质设计工作进行统一，采用了新的接触强度函数．选用蛋白质数据库中的天然蛋白质作为测试靶蛋白，结果表明，采用该模型和方法取得了较好的结果，预测结构相对于天然结构的均方根偏差在0．30～0．70nm之间．该工作为基于相对熵及HNP模型的蛋白