【摘 要】
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为研究甜橙单锌指DNA结合蛋白(DNA binding with one zine finger,Dof)家族的进化关系和该家族成员在不同花期甜橙品种花芽和叶片的表达模式,利用甜橙基因组筛选鉴定CsDof基因家族成员,对甜橙Dof基因家族成员及启动子区进行生物信息学分析,并使用qRT-PCR检测不同花期甜橙品种中CsDof家族成员在成花时期的表达情况.共鉴定出24个CsDof基因家族成员,这些基因分布在甜橙的8条染色体上.系统进化树聚集为9个亚群,CsDofs被分在A、B1、B2、C1、C2.1、C2.2
【机 构】
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赣南师范大学生命科学学院/国家脐橙工程技术研究中心,江西赣州 341000
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为研究甜橙单锌指DNA结合蛋白(DNA binding with one zine finger,Dof)家族的进化关系和该家族成员在不同花期甜橙品种花芽和叶片的表达模式,利用甜橙基因组筛选鉴定CsDof基因家族成员,对甜橙Dof基因家族成员及启动子区进行生物信息学分析,并使用qRT-PCR检测不同花期甜橙品种中CsDof家族成员在成花时期的表达情况.共鉴定出24个CsDof基因家族成员,这些基因分布在甜橙的8条染色体上.系统进化树聚集为9个亚群,CsDofs被分在A、B1、B2、C1、C2.1、C2.2、D1和D2亚群,同一亚群的CsDofs具有相似的基因结构和基序分布.CsDofs启动子区域含大量的光响应元件和激素响应元件.qRT-PCR检测分析发现2个甜橙品种花芽和叶片组织中的CsDofs表达模式存在较大差异,对照品种\'纽荷尔\'花芽和叶片中CsDof6、CsDof11、CsDof13、CsDof17和CsDof21表达量均高于早熟品种\'赣南早\',而\'赣南早\'花芽和叶片中CsDof19和CsDof23表达量高于\'纽荷尔\',表明CsDofs在不同花期的甜橙中具有明显的品种表达特异性,推测CsDofs对甜橙开花时间起重要的调控作用.这些结果为阐明CsDof基因家族在甜橙花期调控中的功能提供了理论参考.
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