【摘 要】
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定量计算药物-靶标亲合性一直是分子靶向药物设计中的核心问题之一.亲合性打分函数适用范围宽、计算速度快且精度良好,特别适合与分子对接等方法联用,在药物研发中得到了广泛的应用.经过20多年的发展,目前存在数量繁多的打分函数,这些方法难免良莠不齐.建立客观公正的针对打分函数性能的评价体系,不仅可以帮助用户做出合理的选择,也为发展打分函数的理论研究人员提供依据,因此是打分函数研究领域中的一个基础问题.近年
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定量计算药物-靶标亲合性一直是分子靶向药物设计中的核心问题之一.亲合性打分函数适用范围宽、计算速度快且精度良好,特别适合与分子对接等方法联用,在药物研发中得到了广泛的应用.经过20多年的发展,目前存在数量繁多的打分函数,这些方法难免良莠不齐.建立客观公正的针对打分函数性能的评价体系,不仅可以帮助用户做出合理的选择,也为发展打分函数的理论研究人员提供依据,因此是打分函数研究领域中的一个基础问题.近年来,我们逐步发展了评价药物-靶标亲合性打分函数性能的方法体系(comparative assessmen
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图像校准是将两两具有公共部分的一组图像通过变换合成到同一个图像的过程.通常这组图像可以是从不同时间、不同传感器(成像设备)或不同条件(气候、亮度、摄像位置和角度等)下获取的.基于任意三角剖分上的多元样条函数,本文提出了图像配准的一种新方法.实验结果表明,与目前国际上流行的其他图像校准方法相比,本文方法计算简单并且得到的合成图像具有更为自然的边界过渡.
利用勒让德多项式逼近理论和高斯-洛巴托求积公式,构造了一个4级4阶的隐式RungeKutta方法.理论分析发现,该算法具有良好的稳定性-是A(α)稳定的且α接近于90~0,是刚性稳定的且D值接近于0,几乎是A稳定的和L稳定的,并能有效求解刚性常微分方程初值问题,数值算例显示了该算法的有效性.
本文给出了三种有限元的特征值方法求解三维Laplace算子特征值和边值问题的数值计算结果;探索了已有的非协调元和协调元的一些理论性质;猜测新的七个自由度三维NF_1元的数值规律.数值实验表明:七个自由度三维NF_1元和三维EQ_1~(rot)元特征值都下逼近准确特征值;七个自由度三维NF_1元和三维EQ_1~(rot)元二网格离散方案特征值都下逼近准确特征值;七个自由度三维NF_1元外推特征值下逼
GaBP(Gaussian Belief Propagation)是一种解线性代数方程组的迭代算法,它是基于递归更新的概率推理算法,具有低复杂性和高并行性.MIC是英特尔的至强融核Xeon Phi的Many Integerated Core架构.它提供数百个同时运行的硬件线程,能充分满足对高并发度的大量需求.本文研究了如何高效地求解大规模稀疏线性方程组的并行算法,通过挖掘GaBP算法特性,优化算法
非奇H-矩阵作为一类特殊矩阵,在科学和工程计算中有着重要的应用.本文利用迭代系数构造正对角阵,给出了非奇H-矩阵的一组迭代判别法,并证明了其充分必要性,推广和改进了近期的一些结果.数值算例也说明了该组迭代判别法的有效性.
本文对嵌套网格上水平集函数的符号函数进行插值,利用插值误差建立运动界面流场的离散多分辨分析,根据多分辨系数确定局部网格尺度和计算格式,构造了一类多尺度水平集方法.对于多分辨系数较大的运动界面附近区域,采用高精度WENO格式进行时间推进,其余区域则直接采用多项式插值.与单一尺度的水平集方法相比,该方法可以在较少的CPU计算时间内捕捉到更为精细、锐利的运动界面.
本文设计了任意维空间中具有线性复杂度的希尔伯特序编码解码算法并提出了希尔伯特空间填充曲线的一种变体.本文同时对编码解码算法进行了改进,设计了复杂度更低的算法,降低了计算量.文中给出的希尔伯特空间填充曲线的变体保证曲线的编码顺序不随曲线阶数的改变而变化.
荧光探针以其高灵敏性和普适性,正成为研究化学、生物、材料科学,以及生物医学等领域相关问题不可或缺的研究工具之一.本文从靶向雌激素受体荧光探针的分类、光学性能、生物活性出发,综述了近年来靶向雌激素受体荧光探针在受体亲和力分析、雌激素受体识别及成像和雌激素信号通路研究等方面的进展,并指出了今后研究的方向和挑战.
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