绵羊ERβ基因的生物信息学分析

来源 :西北民族大学学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:secretcode
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目的:深入探明绵羊ERβ基因结构及其他结构与功能.放法:基于GenBank数据库中绵羊ERβ基因蛋白质编码区(CDS)区序列,利用ORFfinder、ProtParam、BioEdit、SignalP、PSORT II、PredictProtein和SWISS MODEL等工具分析预测ERβ基因编码蛋白的结构、性质、功能及信号通路等,应用NCBI-BLAST、MEGA-X进行基因序列比对,并构建系统进化树.结果:绵羊ERβ基因CDS区共编码527个氨基酸,ERβ基因编码的产物呈疏水性,无信号肽与跨膜结构域.二级结构以α螺旋和无规卷曲为主,三级结构以α-螺旋结构单元为主.ERβ基因主要在细胞核和细胞质发挥生物学作用,这与G蛋白偶联受体活性有密切相关作用.结论:ERβ基因参与多个生殖和肿瘤相关的信号通路.
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