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通过筛选分布于水稻12条染色体上的600个SSR标记进行多态性分析。用吐温法快速提取DNA,利用RM3、RM304和RM475等标记鉴别参与研究的21个杂交旱稻新稻组合及其17个亲本,对杂交稻种子的纯度进行了鉴定;结果表明,新1A/旱恢3号和603A/旱恢25号这两个旱稻新组合的纯度是98.9%,纯度最好;11A/旱恢29号的纯度是87.5%,纯度最差;其它杂交旱稻新组合纯度多在95%左右。