基于单细胞测序探索METTL1与胃癌恶性进展的关联性研究

来源 :右江民族医学院学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:feidog
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的 利用单细胞测序分析胃癌免疫治疗关联性基因,并体外实验验证其与胃癌细胞恶性进展关联性。方法 使用单细胞测序和GESA寻找差异基因,通过相关预后基因构建随机森林模型,通过预测分析对该模型进行了验证,IHC检测METTL1在胃癌患者中的表达,RT-PCR检测沉默METTL1后的效率,CCK-8、细胞克隆和EDU实验检测沉默METTL1对胃癌细胞增殖效率的影响。结果 TCGA数据库和IHC结果均显示METTL1在胃癌组织中高表达。METTL1高表达的患者比METTL1低表达的患者生存率更高(P=0.042)。METTL1及其相关预后基因构建的随机森林模型具有较好的预测价值(AUC=0.863)。CCK-8、细胞克隆和EDU实验显示沉默METTL1抑制了胃癌细胞的增殖。结论 单细胞测序筛选的基因所构建的随机森林模型对预测胃癌患者的生存和免疫治疗敏感性具有较高的预测价值,且METTL1参与胃癌细胞恶性进展过程。
其他文献
目的 了解进展期胃癌免疫治疗的最新研究进展。方法 检索近年来国内外有关进展期胃癌免疫治疗研究的相关文献并进行综述。结果 进展期胃癌免疫治疗主要集中于免疫检查点抑制剂、细胞免疫和抗肿瘤疫苗3个方面,研究最多的是免疫检查点抑制剂,尤其是针对程序性死亡蛋白-1/程序性死亡蛋白配体1、细胞毒性T淋巴细胞相关抗原4和淋巴细胞激活基因3的研究较多,细胞免疫治疗和肿瘤疫苗治疗研究相对较少。虽然免疫治疗单药并没有
期刊
目的 构建基于双硫死亡相关基因的胃癌预后预测模型。方法 首先,从TCGA数据库和GEO数据库获取转录组数据和临床数据,探索双硫死亡相关基因在胃癌组织和正常组织的表达情况及其表达对胃癌患者总生存期(overall survival,OS)的影响。之后,通过一致性聚类确定两个双硫死亡相关基因簇,利用LASSO回归进一步筛选关键基因,并采用多因素Cox比例风险回归构建OS预测模型。结果 在24个双硫死亡
期刊
目的 探讨Ras相关蛋白7A(RAB7A)在胃癌组织中的表达对预后的影响及其作用机制。方法 基于癌症公共数据库和本院接受胃癌根治术的104例患者,分析RAB7A在胃癌及癌旁组织中表达的差异以及其与患者临床病理学参数和预后的关系;采用生物信息学富集分析预测RAB7A影响胃癌侵袭途径的作用和机制;通过慢病毒转染获得过表达和低表达RAB7A的胃癌细胞系(MGC803),采用免疫印迹、划痕及Transwe
期刊
细胞中不同的信号通路交互作用、互相调控形成一个动态的信号转导网络,参与肿瘤的发生发展,而胃癌的转移就是由各种信号通路调节影响的结果。肿瘤转移通常在临床上与较差的患者预后直接相关,因此深入研究影响胃癌转移的信号通路对晚期胃癌患者的治疗可提供帮助。
期刊
目的 研究LINC00342在胃癌组织、细胞中的表达水平及影响胃癌细胞生物学功能的具体通路。方法 运用生物信息学技术,通过GEO数据库及相关预测软件,进行相关筛选及文献查询后,确定所研究的LncRNA及其下游所调控的miRNA;采用qRT-PCR检测LINC00342、miR-596在胃癌细胞系及人胃黏膜细胞中、胃癌组织及相应癌旁组织中的表达差异;细胞生物学功能上,过表达胃癌BGC-823细胞系中
期刊
目的 探讨3H理念护理模式在胃癌患者中的应用效果。方法 选取2019年1月至2022年1月收治的80例胃癌患者为研究对象,按照随机数字表法将其分为对照组(n=40,常规护理干预)和观察组(n=40,3H理念护理模式干预)。比较两组的干预效果。结果 干预后2个月,观察组的对现实与未来的积极态度、与他人维持亲密关系、积极行动评分及总分均高于对照组,差异具有统计学意义(P<0.05)。干预后2个月,观察
期刊
白介素-32(Interleukin-32,IL-32)是一种兼具促炎与抗炎特性的多功能细胞因子,其表达水平已被证明会随着胃黏膜疾病的进展和胃癌(Gastric cancer, GC)的严重程度而升高,从而参与胃“炎-癌”转化的进程。但IL-32究竟是如何影响胃“炎-癌”恶性转化并最终导致GC侵袭和迁移的不良结局仍存在较大争议。为更好地阐明IL-32的异常表达对胃“炎-癌”转化不同组织病理学阶段的
期刊
<正>有创机械通气主要指应用呼吸机,建立人工气道(包括气管套管以及气管插管等)予以机械通气,为重症监护室(Intensive care unit, ICU)患者常用开放气道手段,可有效抢救并且治疗呼吸衰竭。老年患者为有创机械通气治疗的主要群体,更容易出现呼吸衰竭等需要进行生命支持的情况。虽然有创机械通气治疗能够解决通气问题,但是也会增加病原菌入侵途径,提高肺部感染风险[1-2]。尤其是老年患者,身
期刊
<正>甲氨蝶呤是常见的抗肿瘤药物,通过抑制二氢叶酸还原酶阻碍肿瘤细胞DNA合成,抑制肿瘤细胞的生长与繁殖。近年来,随着对疾病和药物研究的深入,甲氨蝶呤被广泛用于治疗类风湿关节炎、银屑病等自身免疫性疾病,并发挥了良好的作用。然而不同患者对甲氨蝶呤的敏感性和耐受性不同,小剂量的甲氨蝶呤也可能引起严重的不良反应。本文就类风湿关节炎患者1例单次使用小剂量甲氨蝶呤引起严重不良反应进行阐述,分析其可能发生的原
期刊
目的 采用稳健排序整合算法(RRA)筛选胃癌潜在的治疗和预后靶点,为胃癌的早期诊断、预后评估和诊断试剂盒的开发提供依据。方法 挖掘高通量基因表达数据库(GEO)中7套胃癌基因表达谱数据(GSE54129、GSE63089、GSE65801、GSE66229、GSE79973、GSE118897、GSE118916),筛选差异表达基因,并对差异表达基因进行基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书
期刊