【摘 要】
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目的:使用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)研究慢性疼痛导致抑郁的脑区基因共表达网络,寻找与之相关的枢纽基因。方法:从基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中下载数据集GSE91396,数据经R软件处理后,用WGCNA构建共表达网络,识别与抑郁脑区相关性高的模块,并对模块内基因进行GO功能注释和KEGG信号通路分析,用Cytoscape软件筛选模块内枢纽基因(hub gene)。结
【机 构】
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陕西师范大学生命科学学院,陕西中医药大学针灸推拿学院,陕西师范大学现代教学技术教育部重点实验室
【基金项目】
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国家青年自然科学基金(82004489),中央高校基本科研业务费项目(GK201703073,GK202105001)。
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目的:使用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)研究慢性疼痛导致抑郁的脑区基因共表达网络,寻找与之相关的枢纽基因。方法:从基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中下载数据集GSE91396,数据经R软件处理后,用WGCNA构建共表达网络,识别与抑郁脑区相关性高的模块,并对模块内基因进行GO功能注释和KEGG信号通路分析,用Cytoscape软件筛选模块内枢纽基因(hub gene)。结
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