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【目的】从转录水平整体分析狗牙根在水淹生境下的基因表达模式对探索植物的抗水淹机制具有重要意义。【方法】本研究通过转录组测序研究了水淹(处理组)和非水淹(对照组)生境下的三峡库区消落带适生狗牙根的转录因子(transcription factor,TF)基因表达变化。【结果】测序数据经拼接共获得147 256条非冗余Unigenes,经Nr、Nt、Swissprot、KEGG、COG、Interpro和GO数据库可注释72.84%的Unigene;筛选到与狗牙根响应水淹胁迫有关的54个家族的785条差