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目的探讨云南省新型农村合作医疗的补偿机制,为维持新型合作医疗提供科学的依据。方法采用现场流行病学方法进行研究。结果在云南省开展新型农村合作医疗试点工作的20个县(市)中随机抽取14个县(市)进行研究,结果表明14个样本县的一年住院封顶线、住院起补线和补偿比例、门诊费用各不相同,补偿比例差异较大。结论云南省各个试点县新型农村合作医疗补偿机制各不相同,建议进一步进行基线调查,科学、合理测算补偿比例,保证合作医疗持续发展。