泡桐的microRNAs及其功能预测

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以不同种(品种)泡桐叶片为材料,利用第二代高通量测序技术和生物信息学方法构建泡桐小RNA(sRNA)文库,并对其microRNA(miRNA)靶基因功能进行分析。结果表明:在得到的87066707条高质量reads中,能与泡桐转录组完全匹配的有41399208条,占高质量序列的47.55%。sRNA长度主要分布在20—25nt之间,其中,长度为24nt的数量最多,其次为21nt的sRNA。鉴定出的44个保守miRNA分属于14个不同miRNA家族,并且不同miRNA家族的miRNA成员数量也存在差异。对鉴
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