基于GEO数据库发现骨肉瘤关键基因GMFG及其生物学功能

来源 :福建医药杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户：ll730520

【摘要】

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目的基于生物信息学方法筛选骨肉瘤(OS)的关键基因及功能预测。方法检索GEO数据库OS数据集(GSE14359),使用GEO2R筛选差异基因(DEGs),构建DEGs的蛋白质-蛋白质相互作用网络(PP

【作者】

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林文韬王武炼肖莉莉张怡元

【机构】

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厦门大学附属福州第二医院骨科

【出处】

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福建医药杂志

【发表日期】

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2020年2期

【关键词】

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骨肉瘤 GMFG 生物信息学 osteosarcomaGMFGbioinformatics

【基金项目】

：

2019年福建省卫生健康青年科研项目(2019-1-84).

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目的基于生物信息学方法筛选骨肉瘤(OS)的关键基因及功能预测。方法检索GEO数据库OS数据集(GSE14359),使用GEO2R筛选差异基因(DEGs),构建DEGs的蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI)以及Cytoscape可视化分析确定关键基因。并进一步下载关键基因共表达基因,基因本体(GO)和(京都基因与基因组百科全书)KEGG分析预测其可能的生物功能。结果通过对原发OS组织、OS肺转移组织和原代成骨细胞之间的差异性和维恩图分析,获得385个交集基因。进而使用蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)和Cyt

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