龙眼miR171家族进化特性及其表达分析

来源 :西北植物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：joyuan100

【摘要】

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为了解龙眼miR171家族的进化特性及其功能，该研究以龙眼mRNA和miRNA数据库中获得的miR171家族7个前体序列(pre-miRNA)和9条成熟体序列为基础进行生物信息学预测和表达分析。mf

【作者】

：

曾友竞林玉玲崔彤彤陈晓慧徐小萍张梓浩程春振陈裕

【机构】

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福建农林大学园艺植物生物工程研究所

【出处】

：

西北植物学报

【发表日期】

：

2017年2期

【关键词】

：

龙眼 miR171 生物信息学实时荧光定量 Dimocarpus longanLour. miR171 bioinformatics realtime f

【基金项目】

：

福建省自然科学基金杰出青年项目(2015J06004),国家自然科学基金(31672127,31572088),福建省重大专项(2015NZ0002-1),福建省新世纪人才项目(20151104),福建农林大学“杰出青年科研人才”培养专项基金(xjq201405)

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为了解龙眼miR171家族的进化特性及其功能，该研究以龙眼mRNA和miRNA数据库中获得的miR171家族7个前体序列(pre-miRNA)和9条成熟体序列为基础进行生物信息学预测和表达分析。mfold预测显示，pre-miR171家族成员均能形成典型二级结构，其最小折叠自由能（dG）介于-39.37~-55.13kal/mol，且家族成员中除pre-miR171-scaffold112和pre-miR171f-scaffold38外，其他成员包含的成熟序列与vvi-miR171a、ptc-miR171

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