甘薯G病毒吉林分离物的全基因组序列测定与分析

来源 :植物保护 | 被引量 : 0次 | 上传用户：cpu1987

【摘要】

：

利用RT-PCR结合RACE方法,从感染SPVG的甘薯叶片中获得甘薯G病毒吉林分离物Jilin-gzl的全基因组序列。测序获得的Jilin-gzl分离物(GenBank No.Mk392509)基因组为10 797 nt。该

【作者】

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马俊丰李小宇张春雨周雪平王永志

【机构】

：

吉林农业大学,吉林省农业科学院,中国农业科学院植物保护研究所

【出处】

：

植物保护

【发表日期】

：

2020年3期

【关键词】

：

甘薯G病毒(SPVG) 全基因组比对分析系统发育 Sweet potato virus G(SPVG)complete genomecomparative

【基金项目】

：

国家重点研发计划(2017YFD0201604),吉林省农业科技创新工程(CXGC2017JQ021),吉林省农业产业技术体系马铃薯(甘薯)综合栽培技术示范与推广(2018)

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利用RT-PCR结合RACE方法,从感染SPVG的甘薯叶片中获得甘薯G病毒吉林分离物Jilin-gzl的全基因组序列。测序获得的Jilin-gzl分离物(GenBank No.Mk392509)基因组为10 797 nt。该病毒基因组含有一个10 464 nt的开放阅读框,编码由3 488个氨基酸构成的多聚蛋白。在P1和P3基因中也发现了由移码翻译产生的PISPO蛋白和PIPO蛋白。比对分析显示,在开放阅读框水平上Jilin-gzl与6个不同分离物核苷酸序列一致性为79%~99%,氨基酸一致性为92%~9

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