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针对投入变量缺失生产服务系统,提出一种基于DEA的相对效率评价方法。由于该系统的投入无法确知,首先需要依据产出对各决策单元(DMU)进行分组,并将其相对效率分解为组内效率与组间效率。对于组内效率,引入虚拟投入变量利用传统超效率DEA模型进行评价。而对于组间效率,则建立扩展的超效率DEA模型。最终以两类效率之积评价所有决策单元之间的相对效率。理论分析表明:投入缺失系统内决策单元有效的充要条件是其组内效率及其所在组的组间效率均有效。文章最后以基金项目评审为例进行实证分析,说明了本方法的合理性与可行性。