基于数据库的胃癌相关差异表达基因筛选及生物学功能分析

来源 :山东医药 | 被引量 : 0次 | 上传用户：madiawang

【摘要】

：

目的基于数据库筛选胃癌相关差异表达基因,分析胃癌相关差异表达基因的生物学功能及相关信号通路,探索胃癌相关核心差异表达基因与胃癌预后的关系。方法从GEO数据库选取胃癌

【作者】

：

张越时郭隽馥

【机构】

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辽宁中医药大学医学检验学院,辽宁中医药大学教学实验中心

【出处】

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山东医药

【发表日期】

：

2020年27期

【关键词】

：

【基金项目】

：

国家自然科学基金资助项目(81803855),辽宁省博士启动项目(2019-BS-166),沈阳市中青年科技创新人才支持计划项目(RC190078)

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目的基于数据库筛选胃癌相关差异表达基因,分析胃癌相关差异表达基因的生物学功能及相关信号通路,探索胃癌相关核心差异表达基因与胃癌预后的关系。方法从GEO数据库选取胃癌相关基因芯片GSE79973、GSE54129,应用GEO2R分别筛选出两组芯片胃癌组织与正常胃黏膜组织的差异表达基因,取交集后得到共有差异表达基因。应用DAVID对差异表达基因进行生物学功能及信号通路分析。采用STRING构建差异表达基因蛋白互作网络,应用Cytoscape软件的MCODE插件筛选胃癌相关核心差异表达基因。对核心差异表达基因与

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