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两平行光子晶体单模波导的相互耦合组成一个耦合结构。两本征模的色散曲线相交并出现简并，简并模之间的耦合作用使模式的分布发生了改变。由于耦合的作用，各个波长的光波会在不同的波导中传输。在简并点处两本征模发生解耦合，光波会沿着原来的方向传输。将两个不同耦合长度的光子晶体波导耦合结构集成在一起，就可以组成一个三波长的光子晶体波分复用器。