瓠瓜类型砧木遗传作图群体双亲多态性分析

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以耐湿涝瓠瓜类型砧木材料JZS与不耐湿涝材料T2002为遗传作图双亲,利用随机扩增多态性DNA(random amplification polymorphicDNA,简称RAPD)法与瓠瓜及其他近源瓜类简单重复序列(simple sequence repeat,简称SSR)进行多态性分析。从供试1 678个RAPD、SSR标记中共筛选到26个多态性引物,其中包括14个RAPD、4个瓠瓜SSR、2个甜瓜SSR、5个黄瓜SSR、1个南瓜SSR,扩增出28个多态性位点。几种标记多态性检测效率不同,瓠瓜SSR引物揭示,双亲多态性比例最高(0.47%),其次是RAPD(0.38%),近源瓜类SSR选择效率最低,仅有0.14%0.15%。结果表明,尽管瓠瓜作图亲本表型差异大,但分子标记结果显示亲本遗传背景相近;甜瓜、黄瓜和南瓜与瓠瓜亲缘关系远,具有种属特异性的SSR引物在瓠瓜亲本JZS、T2002多态性分析中通用性不高。为了提高分子标记多态性分析效率,绘制高密度遗传图谱,下一步应尽快开展基于基因组测序技术检测单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,简称SNP)位点的研究。
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