两会期间，政协一号提案《关于完善我国多层次资本市场税收政策》一出，便直指资本市场税收政策。
　　首先摆上台面的便是备受争议的印花税的课收。
　　民建中央提出，要完善证券交易印花税征收方式。重新设计差别比例税率，税收应充分考虑投资者交易额的大小和持有时间的长短，以保护广大中小投资者和鼓励中长线投资；税收政策应鼓励集中交易，对场内交易实行较低税率，对场外交易实行较高税率；另外，税收政策还应考虑改买方纳税为卖方纳税。
　　“目前来看，印花税确实偏高，无论是采取单向收费，还是降价的手段进行调节，都是可以考虑的。”中央财经大学中国银行业研究中心主任郭田勇说。
　　北京师范大学金融研究所所长韩复龄也认为印花税征收偏高。他介绍，去年沪深两市中，股市投资者所缴纳的印花税就达到了2005个亿，而交给证券公司的手续费等其它费用也有1000多个亿，但是上市公司的总利润也就3000多亿。这样算来，印花税征收的确偏高，“去年刚刚提高了印花税，即便是偏高也不能马上就降，这需要一个时机。不过，我更倾向于将印花税改为单边征收。”
　　政协1号提案中征收资本利得税的提议受瞩目更受非议。
　　台湾学者陈松兴建议以资本利得税代替印花税，“股市交易有输有赢，而印花税只是简单的课税，不能兼顾各方利益。收取印花税只是作为庄家的政府在收进场费。而在国外，很多国家都是不收印花税的。”陈松兴说，从国内市场发展来看，最好能够征收资本利得税，虽然对股市会有一定的打压，但是有利于市场的长久发展。
　　民建中央建议，税收政策要注意投资所得税与个人和企业所得税的衔接。建议取消按红股面值20%计征所得税的规定，对红股(即红利)征税从分配环节征税改为变现环节征税，并提议适时开征证券所得税。
　　郭田勇认为目前谈征收资本利得税有点为时过早。
　　“从发展中国家股票市场发展来看，为培育股票市场，税收政策应该从宽而非从紧。”郭田勇说，从我国融资结构来看，目前，间接融资比例占80%，直接融资仅占10%多一些，大力发展直接融资是国家发展的重点，因此，税收政策不宜操之过急。目前开征资本利得税不利于新兴的资本市场的发展。
　　“资本利得税的征收关键是看怎么操作，技术性操作难度比较大，如征收周期等。”韩复龄说，各税收的课征都要求公平，资本利得税也不例外。如存款利息税，在最初阶段也曾计划分收入以及存款数额的人群不同进行征收，以便区别对待，但最后因为技术层面不好操作而不了了之，最后还是实行了一刀切。