甜菜M14品系BvM14-UNG基因克隆及生物信息学分析

来源 :中国农学通报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:huangxinyu322
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为研究Bv-UNG蛋白在植物碱基切除修复(base-excision repair,BER)途径中的功能,以甜菜M14品系为材料,根据NCBI上二倍体栽培甜菜UDG编码基因Bv-UNG序列,利用同源序列克隆法获得甜菜M14品系BvM14-UNG基因cDNA全长,并对其进行生物信息学分析.结果 表明,该基因编码374个氨基酸,BvM14-UNG蛋白表现出较强的亲水性,为可溶性蛋白,主要由无规卷曲和α螺旋构成,具有水激活基序、尿嘧啶结合基序、小沟插入环基序、尿嘧啶糖基化酶抑制剂(uracil glycosylase inhibitor,UGI)结合位点和亮氨酸(Leu)位点,属于UDG-F1亚家族,BvM14-UNG蛋白与甜菜BvUNG蛋白亲缘性最近,其次为藜麦CqUNG蛋白.本研究可为后续开展甜菜M14品系BER途径中BvM14-UNG酶活性研究提供参考.
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