GEO-基因表达综合数据库的应用与数据挖掘

来源 :医学分子生物学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:qq237599512
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
高通量微阵列杂交技术和测序技术的快速发展,产生了大量的基因数据,生物信息迅速膨胀成为数据的海洋。为适应这种高通量基因表达数据的不断增长和人们共享数据的需要,各种数据库应用而生,其中,NCBI(national center for biotechnology information)的基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)是世界上最大的储存高通量分子丰度数据的公共数据库,用户可以提交、储存和检索多种形式的数据并免费使用。迄今为止,GEO已收录了300000个样本的数据
其他文献
随着社会的发展和电力体制改革的不断推进,电力营销逐渐成为电力行业经营与发展中很重要的一个环节。电力企业要想在激烈的竞争中保持优势地位,并不断发展壮大,必须抛弃传统垄断
目的:克隆牙龈卟啉单胞菌菌毛蛋白fimA基因,并使其在大肠杆菌中融合表达。方法:利用PCR方法克隆fimA,并用基因重组融合表达技术获得在大肠杆菌中的表达。结果:克隆基因测序结
目的 研究γ射线对人外周血淋巴细胞 cx43和ANLN基因转录表达的影响.方法 对数生长期的淋巴细胞,分别给予1、2、3、4、5、6 Gy的60Coγ射线照射,照射后12 h,以及2 Gy照射后4
研究猪油、淀粉和鸡蛋3种酵解液与磁黄铁矿、黄铁矿间的相互作用。结果表明3种酵解液水溶性有机物群中,因某些有机物质的活性的存在而与氧化状态中硫化矿粉间有明显的相互作
在兔的动物实验中,为了减少动物的痛苦,保证实验操作顺利进行,经常采用麻醉处理.但是麻醉期间容易出现实验兔肺水肿问题,导致动物死亡,实验失败.我们在一例麻醉引起的实验兔
目的 探讨构建兔HPRT基因打靶载体的方法,为下一步获得兔 HPRT基因敲除动物模型和转基因兔奠定基础.方法 首先在已经筛选到含有兔全长次黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖转移酶 (Hypoxa
从牙鲆(Paralichthys olivaceus)海水循环养殖系统中移动床生物滤器载体生物膜上获取异养细菌、氨化细菌和硝化细菌样本.异养细菌用平板涂布法计数,其代谢活性以培养8 h的氧
目的:构建含有人肾细胞癌特异性抗原G250(CAⅨ)主要T细胞表位区域、猴和鼠CAⅨ部分片段区域融合基因tG250的真核表达质粒,并在猴肾COS7细胞中表达.方法:通过基因合成和PCR技
目的:探讨根端囊肿、含牙囊肿及角化囊肿衬里上皮中Survivin、Ki67的表达及意义.方法:采用免疫组化法检测12例根端囊肿、20例含牙囊肿、22例角化囊肿中Survivin、Ki67表达水
血清多肽组谱图(简称血肽图,serum peptidome profiling)是指通过质谱分析技术获得的血清中多肽组的精确质量数的谱图,是临床蛋白质组学研究领域的一个分支,在生物标志物的发