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对稻瘟病拮抗细菌-短小芽孢杆菌（Bacillus pumilus)的发酵液在260nm和280nm下进行吸光度测定。结果表明，发酵液中蛋白质含量明显高于对照液；在发酵液和对照液中分别加入质量分数40%饱和度的硫酸铵，3000r/min离心30min得沉淀，经SDS-聚丙烯酰胺凝胶垂直电泳分析，初步确定发酵液中新产生3种多肽物质；发酵液经胰蛋白酶和100℃高温处理后，对稻瘟病菌分生孢子的萌发率明显减弱。结果表明，稻瘟病拮抗细菌有效作用成分为多肽类物质。