研究先天性巨结肠(HSCR)肠管组织和血清微小核糖核酸(miRNA)的表达差异。
方法取52例经手术和病理确诊的HSCR患儿无神经节细胞肠管组织和正常结肠组织标本，以及52例HSCR患儿和52例健康婴儿的血清标本(20例用于样本检测，32例肝扩大样本量验证)。应用microRNA TaqMan Low Density Array技术，分别检测无神经节细胞肠管和正常对照结肠肠管、HSCR患儿和健康婴儿血清标本的miRNA表达谱，对肠管组织和血清miRNAs表达谱进行整合分析，确定HSCR无神经节细胞肠管和血清miRNAs特异性表达情况。对肠管组织和血清一致性异常表达的miRNAs首先进行芯片样本独立验证，然后对32对肠管组织和血清样本进行扩大样本量验证，并对一致性异常表达的miRNAs进行靶基因预测。
结果与正常结肠组织相比，有47个miRNAs在HSCR无神经节细胞肠管组织中呈差异表达，其中17个miRNAs表达上调，30个miRNAs表达下调；HSCR患儿血清中有32个miRNAs呈差异表达，均为表达上调。miR-218-1和miR-885-5p为在HSCR无神经节细胞肠管和血清中呈一致性差异表达的miRNAs。芯片样本独立验证及扩大样本量验证显示，miR-218-1和miR-885-5p在HSCR无神经节细胞肠管和血清中均呈显著性高表达，差异有统计学意义(miR-218-1：组织芯片样本0.017 58±0.002 29比0.003 37±0.000 50，P<0.001；组织扩大样本量0.013 53±0.001 74比0.004 43±0.000 60，P<0.001。miR-885-5p：组织芯片样本0.000 30±0.000 11比0.000 04±0.000 008，P＝0.027 6；组织扩大样本量0.004 59±0.000 16比0.000 04±0.000 01，P＝0.014 5。miR-218-1：血清芯片样本0.769 60±0.285 50比0.045 14±0.015 07，P＝0.015 5；血清扩大样本量1.151 00±0.430 00比0.023 07±0.003 81，P＝0.008 7。miR-885-5p：血清芯片样本1.595 00±0.441 70比0.169 40±0.034 46，P＝0.001 2；血清扩大样本量1.689 00±0.453 00比0.146 10±0.031 24，P＝0.001 2。生物信息软件预测显示miR-218-1和miR-885-5p的共同靶基因是酪氨酸激酶受体基因RET、PLAG1和NeuroD1。
结论HSCR无神经节细胞肠管和患儿血清均存在显著差异表达的miRNAs，其中miR-218-1和miR-885-5p呈一致性高表达，可能与HSCR的发生有关。