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在DEA框架下测算新疆兵团农业在特定环境压力下的生态效率，并采用截断回归和自举估计法分析农业生态效率的影响因素。研究结果表明：新疆兵团农业的生态效率很低，在特定环境压力下团场之间的生态效率差异很小，管理活动中生态无效率和技术无效率密切相关。资源过度消耗和污染物过量排放是新疆兵团农业生态效率较低的主要原因，因此，依靠农业科技进步，提高劳动者素质，转变农业发展方式是提高兵团农业生态效率的重要途径。