【摘 要】
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目的分析编码TRIM5α蛋白的基因2号外显子单核苷酸基因多态性(single nucleotide polymorphisms，SNPs)与艾滋病的相关性，并探讨病毒亚型对此相关性的影响。方法从331例已确诊但未接受治疗的HIV-1感染者的外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell，PBMC)中提取基因组DNA，扩增HIV-1病毒的Gag基因和编码TRIM
【机 构】
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150081 哈尔滨医科大学药学院，哈尔滨医科大学基因组中心,150081 哈尔滨医科大学药学院，哈尔滨医科大学基因组中心,150001 哈尔滨医科大学第四医院感染科,150081 哈尔滨医科大学药学
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目的分析编码TRIM5α蛋白的基因2号外显子单核苷酸基因多态性(single nucleotide polymorphisms，SNPs)与艾滋病的相关性，并探讨病毒亚型对此相关性的影响。
方法从331例已确诊但未接受治疗的HIV-1感染者的外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell，PBMC)中提取基因组DNA，扩增HIV-1病毒的Gag基因和编码TRIM5α蛋白基因的2号外显子基因并获得基因序列信息，统计单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms，SNPs)和构建Gag基因系统进化树图。以CD4＋T淋巴细胞数200个/μL为界值将HIV-1感染者分为快速进展组(CD4<200)和慢速进展组(CD4≥200)，并分析比较所有331例样本和各HIV-1亚型中TRIM5α基因多态性与艾滋病的相关性。
结果在全部扩增的331条HIV-1的Gag基因中，有239条Gag基因序列与不同的CRF01_AE亚簇聚集，CRF01_AE亚型感染者占所有感染者的72.2%，其他亚型较少，故不进行相关性分析。我们共发现4个SNP位点(-2GC、127CT、334GT和407GA)，其中407GG基因型在所有样本和CRF01_AE感染者的快速进展组和慢速进展组中都有明显的统计学差异(P<0.05)，而407GA基因型只在CRF01_AE感染者中有统计学差异。
结论突变位点-2G/C、127C/T、334G/T和HIV-1的感染无相关性，407G/A突变可能与宿主TRIM5α蛋白抗HIV-1的作用增强相关，而HIV-1病毒型别是研究TRIM5α基因多态性和艾滋病相关性应该考虑的因素。
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