柑橘密码子用法分析

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采用高频密码子分析法,对柑橘的177个蛋白质编码基因序列(coding DNA sequence,CDS)进行了分析,计算出同义密码子相对使用频率(relative frequency of synonymous codon,RFSC),确定了TAA、GCT、GAT、CTT、AGG、AGA和GTT等7个高频密码子.将柑橘的密码子使用频率与人、果蝇、酵母和大肠杆菌等不同种类模式生物比较后发现,柑橘密码子的偏爱性与不同种类生物有不同程度的差异;但将柑橘的密码子使用频率与拟南芥、番茄、水稻和尖叶蕉等不同种类的植
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