【摘 要】
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为探索大菱鲆(Scophthalmus maximus)耐高温的分子机制,筛选耐高温相关基因,采用高通量测序平台(IlluminaHiSeq-2500)分别对5个不同高温处理组的大菱鲆肾脏组织开展转录组测
【机 构】
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中国水产科学研究院黄海水产研究所,上海海洋大学水产与生命学院,青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋生物学与生物技术功能实验室
【基金项目】
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现代农业产业技术体系专项(CARS-47-G01),青岛海洋科学与技术试点国家实验室“鳌山人才”培养计划项目(2017ASTCP-OS04),国家自然基金项目(41706168),山东省良种工程(2016LZGC031),中国水产科学研究院基本科研业务费(2016HY-JC0302)共同资助
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为探索大菱鲆(Scophthalmus maximus)耐高温的分子机制,筛选耐高温相关基因,采用高通量测序平台(IlluminaHiSeq-2500)分别对5个不同高温处理组的大菱鲆肾脏组织开展转录组测序,进行生物信息学分析,包括GO(基因功能注释)、SSR(简单重复序列)分析等。结果显示,通过组装得到Unigenes总数目为68525,长度范围为201~23456 bp,平均长度为1124 bp,N50长度为2316 bp。将Unigenes分别在Nr、Swissprot、KEGG、KOG、GO数据库
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