目的分析新疆维吾尔自治区2009-2013年连续5年5岁以下儿童死亡变化趋势及主要死亡原因,寻求降低5岁以下儿童死亡率的干预措施。方法按《中国5岁以下儿童死亡监测方案》要求收集质量控制后的儿童花名册、儿童死亡报告卡及儿童死亡监测表;然后对收集的资料进行整理、统计分析。结果新疆维吾尔自治区5岁以下儿童死亡率由2009年的29.43‰下降至2013年的24.85‰。新疆维吾尔自治区农村5岁以下儿童死亡率明显高于城市水平。农村、城市5岁以下男童死亡率高于女童。早产或低出生体重、肺炎、出生窒息、腹泻、溺水是新疆维吾尔自治区农村5岁以下儿童死亡的主要原因,早产或低出生体重、肺炎、出生窒息、先天性心脏病、意外窒息是城市5岁以下儿童死亡的主要原因。新疆维吾尔自治区农村5岁以下死亡儿童死前住院治疗构成比低于城市,未治疗构成比高于城市;途中和家中死亡构成比高于城市;农村5岁以下死亡儿童死前未就医构成比明显高于城市。结论新疆维吾尔自治区农村地区应加强妇女儿童保健工作。在农村,儿童保健要深入到各个家庭,儿童保健服务项目要落到实处,加强产、儿科建设,改善滞后的局面;应大力推广儿童肺炎、腹泻防治适宜技术和新生儿窒息复苏技术的培训;减少意外死亡;提高家长自觉进行儿童保健的意识,降低儿童死亡前未治疗现象。