登革3型病毒07CHLS001株全基因组序列测定和分析

来源 :中国预防医学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户：ranandong

【摘要】

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目的对登革3型病毒浙江分离株07CHLS001进行了全基因组序列测定和分析，为探讨其基因组特征和来源提供依据。方法根据登革3型病毒98TW407株设计22对引物，利用RT-PCR法扩增出07CH

【作者】

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雷永良陈燕飞叶碧峰梅建华陈秀英兰进权李永芬

【机构】

：

丽水市疾病预防控制中心

【出处】

：

中国预防医学杂志

【发表日期】

：

2008年11期

【关键词】

：

登革病毒 3型基因组序列分析 Dengue virus type 3 Genome Sequence analysis

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目的对登革3型病毒浙江分离株07CHLS001进行了全基因组序列测定和分析，为探讨其基因组特征和来源提供依据。方法根据登革3型病毒98TW407株设计22对引物，利用RT-PCR法扩增出07CHLS001株基因组不同区段的eDNA片段，通过序列测定和拼接获得其全基因组序列。结果07CHLS001株基因组全长10707 nt，包含一个开放读码框（95-10 267nt），编码3390个氨基酸。它与登革3型病毒ThD3-1687-98株、98TW407株和80-2株的全基因组序列核苷酸相似性依次为98．7％、

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