【摘 要】
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目的通过数据库挖掘寻找肝癌差异长链非编码RNA并预测其调控机制。方法从TCGA数据库中下载374例肝癌样本和50例正常样本lncRNA、miRNA、mRNA的测序数据,筛选出差异基因后构建
【机 构】
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郑州大学第二附属医院检验科,郑州大学第二附属医院肿瘤科,郑州大学消化疾病研究所
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目的通过数据库挖掘寻找肝癌差异长链非编码RNA并预测其调控机制。方法从TCGA数据库中下载374例肝癌样本和50例正常样本lncRNA、miRNA、mRNA的测序数据,筛选出差异基因后构建ceRNA网络关系图,对差异基因进行生存分析。设置差异倍数(foldChange)≥2,P<0.01。结果在差异基因中发现77个lncRNA与miRNA相关,其中6个(HTR2A-AS1、AC073352.1、AL359878.1、AP002478.1、C2orf48、MYLK-AS1)与肝癌的总生存期相关;并发现
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