运用生物信息学筛选甲状腺乳头状癌生物靶点

来源 :中国普外基础与临床杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kona
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的 进一步了解甲状腺乳头状癌(papillarythyroidcarcinoma,PTC)发生发展的生物分子机制,寻找新的临床病理特征判断依据以及预后评价和靶向治疗的新分子靶点.方法 通过分析基因表达综合数据库(GEO)中相关样本的基因芯片数据,筛选出PTC与正常甲状腺组织细胞中的差异表达基因(the differentially expressed genes,DEGs).运用STRING 及DAVID 在线数据库对DEGs 进行蛋白互作(the protein-protein interaction,PPI)网络分析、GO功能和生物学途径富集通路分析以及KEGG代谢通路分析,并从中筛选出关键基因.结果 本研究共筛选出339个DEGs及10个关键基因,其中FN1、CCND1、TIMP1、ICAM1、APOE、MET、RUNX2、KRT19和SERPINA1在PTC中的表达上调,KIT在PTC中的表达下调.在对假设检验做多重检验校正后,可得APOE[错误发现率(false discover rate,FDR)=0.047 5]及KIT(FDR=0.042 0)基因表达的改变对PTC 患者的无复发生存期(recurrence-free-survival,RFS)有一定的影响,具有统计学意义.结论 FN1、ICAM1、APOE、MET、KRT19、KIT和SERPINA1基因相对高表达的改变可能与PTC的预后有关.但需要进一步的研究来具体阐明这些基因在PTC发生发展过程中的生物作用机制.
其他文献
目的 建立预测胃癌总体生存率的新模型,以指导临床工作.方法 通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库,下载胃癌患者的临床信息和基因组测序信息,通过单因素COX回归和Lasson回归筛选
目的 探讨长链非编码RNA (lncRNA)FoxP4-AS1在甲状腺乳头状癌(PTC)中的表达情况及其与淋巴结转移的相关性.方法 采用实时荧光定量聚合酶链反应法检测52例PTC癌组织及其对应的
目的 比较伴或不伴糖尿病的细菌性肝脓肿(BLA)的临床特征差异,为临床诊疗提供参考.方法 回顾性分析2016年1月至2020年1月期间南京医科大学附属淮安第一医院收治的BLA患者的临
目的 从转录组学层面研究肝内胆管癌(ICC)发生异常的生物学通路并发现与ICC预后相关的基因.方法 通过t检验和倍数变化法筛选差异表达基因并对相关基因进行KEGG功能富集分析;
目的 总结在脓毒症治疗中硫化氢调节自噬保护器官损伤的作用机制.方法 检索近年来国内外关于硫化氢调节自噬、保护脓毒症器官损伤的作用机制的研究并进行综述.结果 硫化氢作
清晨打开手机,被朋友发来的一组照片惊住。在市区一家华丽的大酒店里,一对中年夫妻在请父母吃饭,偌大的餐桌上,依次摆滿了各色菜肴。各种菜品,荤素齐全,搭配合理,看得人垂涎欲滴,满满的仪式感。  这让我想起了姐姐的孝亲故事。母亲年事已高,年过七旬的她久住乡下,目的自然是不打扰儿女。为了方便回家,两年前我买了一辆微型面包车,售卖干果之余,半月回家一趟,顺便给母亲捎去一些果蔬和日用品。姐姐与我同城而居,因为
期刊
目的 探讨血脂相与浸润性乳腺癌分子分型的相关性.方法 选取西南医科大学附属医院乳腺外科2018年1月至2019年6月期间收治确诊为原发性浸润性乳腺癌患者375例,检测其血清总胆
目的 探讨腹腔镜前入路右半肝切除术的临床应用价值.方法 回顾性分析2017年6月至2019年5月期间自贡市第四人民医院肝胆胰脾诊疗中心收治的32例行腹腔镜前入路右半肝切除术患
期刊
精子的“武侠世界”里有许多“恶人”,整日与它们为敌,杀伤极多。  1.吸烟 研究发现,吸烟是造成男性不育症的重要原因之一。烟叶中的尼古丁会降低性激素分泌、杀伤精子。  2.酗酒 酗酒可损害男性生殖器官,引起血清睾酮水平降低,从而引起性欲减退、精子畸形。过度饮酒还易诱发前列腺炎,甚至影响性功能,造成不育。  3.性生活不规律 一次射精后,男性需要5~7天才能恢复有生育力的精子数量。性生活过频会导致精
期刊